Bioinformoodics
Mood Disorders Center
我们的计算科学家团队一直忙于开发一些生物信息学和分析资源和工具，用于研究情绪障碍的遗传原因及其治疗反应. 本网站提供各种资源和工具的链接.
Database Servers
Metamoodics
Metamoodics是一个生物信息学资源，综合了正在进行的情绪障碍遗传研究的结果, including depression and bipolar disorder, 并在他们的基因组背景下展示这些发现. It includes data from genetic association, expression and linkage studies, 并将很快包括来自测序和甲基化研究的新数据. 提供已发表研究的meta或大型分析结果. Metamoodics的目标是创建一个中心资源，研究人员可以探索我们目前对抑郁症和双相情感障碍的遗传贡献的了解，并利用这些信息来发展或评估促进我们对这种贡献的理解的假设.
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SynaptomeDB
SynaptomeDB is an integrated database to retrieve, compile, and annotate genes comprising the synaptome. These genes encode components of the synapse, including neurotransmitters and their receptors, adhesion/cytoskeletal proteins, scaffold proteins, transporters and others. SynaptomeDB系统地查询现有的生物信息学资源，并编译这些基因产物的基因组和蛋白质组学信息. Genes operating in the synapse are potentially important to psychiatric disorders; this resources provides a comprehensive catalogue of what genes these are and what they do.
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The Bipolar Disorder Phenome Database
约翰霍普金斯大学和NIMH的研究人员共同创建了这个数据库, which posts the clinical phenotypes of over 5,000人被招募进行双相情感障碍遗传学研究. 双相情感障碍表型数据库旨在补充通过人类基因组计划生成的大量遗传数据, The International HapMap Consortium, the Genetic Analysis Information Network, and similar efforts. 目标是加速发现导致这种常见且经常致残的疾病的基因, 通过促进临床亚型的遗传分析. 研究人员现在可以探索临床变量和遗传学之间的联系，并有足够数量的受试者来检测甚至是适度的遗传影响.
Chromosome 8 SNP Data
约翰霍普金斯大学和密歇根大学合作研究了基因1型,461 SNPs on chromosome 8q24 in 3,512 individuals, of whom 1,954 were affected with bipolar disorder. 这些个体来自737个家庭，包括1个,142 nuclear families and broke down into 1,840例亲本影响后代三联症(573例亲本为零基因型), 641 with one genotyped parent, 626对父母有两个基因型)和333对不一致的兄弟姐妹. 这些个体是通过约翰霍普金斯大学的情绪障碍研究项目确定和评估的，也是国家精神健康遗传研究所双相情感障碍倡议的一部分. 染色体8q24是双相情感障碍最有希望的连锁区域之一, 生成这些数据是为了绘制该区域的精细地图并寻找关联. 基因型和表型数据已经过充分审查，并提供给合格的研究人员，以促进对这一有前途的基因座的研究，并促进分析这类家庭数据的统计方法的发展.
Web Applications
SVAw
SVAw(或代理变量分析web应用程序)是一个web应用程序，致力于解决由可测量和不可测量因素(如环境)引起的基因表达数据异质性问题, demographic, genetic and technical factors. 它使用Leek JT和Storey JD (PMID: 204228335)开发的算法，为基因表达数据的替代变量分析提供了一个用户友好的半自动化网络平台。.
QuickSNP
QuickSNP的开发是为了帮助研究人员以经济有效的方式选择snp进行关联研究. 它允许以自动方式从染色体区域进行以基因为中心的SNP选择, automated selection of coding non-synonymous SNPs, and SNP filtering based on inter-SNP distance. 它还提供了snp基因分型分析的可用性信息, and availability of SNPs on whole genome chips, 它产生用户友好的汇总表和结果，以及链接到UCSC基因组浏览器轨道, 说明所选择的标签snp与基因和其他基因组特征的关系.
Analytic Tools
Whole Exome Sequencing Pipeline
我们已经开发了一个由一系列编程脚本组成的管道，用于管理和分析来自全外显子组测序研究的数据. 这种半自动化的管道建立在几种开源技术之上，使用标准文件格式和多种质量控制检查，从输入的fastq文件生成不同的调用. 对变量调用进行注释，然后为下游分析做好准备.